为了提高脱氮除磷的要求，将传统脱氮除磷工艺应用到MBR工艺中，MBR工艺的一些自身特性可以对原有的脱氮除磷工艺起到强化作用,即便传统工艺中遇到的技术问题同样会在MBR脱氮除磷工艺中出现。
以下将介绍多种形式的MBR脱氮除磷组合工艺
SBR -MBR工艺
SBR (序批式反应器)作为一种改良型的活性污泥处理工艺，利用时间上的推流代替空间上的推流，即以时间换空间的概念。该工艺集进水、厌氧、好氧、沉淀于一池，不但可以为实现生物脱氮除磷提供条件，还可以灵活变换运行方式以适应不同类型污水的处理要求，便于自动控制等。
由于膜组件的截留过滤作用，反应中的微生物能大限度地增长，利于世代时间较长的硝化及亚硝化细菌的生长繁殖，因此，污泥的生物活性高，吸附和降解有机物的能力较强，同时也具有较好的硝化能力。
此外，SBR式的工作方式为除磷菌的生长创造了条件，同时也满足了脱氮的需要，使得单一反应器内实现同时去除氮磷及有机物成为可能。
A2O-MBR工艺
相比传统的生物脱氮工艺来说，设置了厌氧、缺氧和好氧反应器的A2O工艺则可以实现同步除碳和脱氮除磷功能。A2O-MBR工艺具有同步脱氮除磷功能，可进一步拓展MBR的应用范畴。
A2O-MBR工艺中高浓度的MLSS、独立控制的水力停留时间和污泥停留时间、回流比及污泥负荷率等都会产生与传统A2O工艺不同的影响，具有较好的脱氮除磷效率。
